Descifran el genoma de la calabaza y encuentran genes relacionados con la forma de sus frutos

El genoma de la calabaza ha dejado muchas preguntas… ¿Por qué algunas calabazas son redondas y achatadas, mientras otras crecen largas y alargadas? Parte de la respuesta está en su ADN. Un equipo de científicos chinos logró construir un mapa casi completo del genoma de la calabaza e identificó genes candidatos que podrían ayudar a explicar estas diferencias.

La investigación, publicada en Horticulture Research, ofrece información más precisa para estudiar características como la forma del fruto, el grosor de su pulpa y su composición.

Un mapa del genoma de la calabaza con menos espacios en blanco

El genoma es como un gran libro de instrucciones que contiene la información genética de un organismo. El problema es que las versiones anteriores del mapa de la calabaza tenían miles de fragmentos sin identificar, lo que dificultaba encontrar genes relacionados con características importantes para su cultivo.

Los investigadores de la Academia de Ciencias Agrícolas de Guangdong y la Universidad Agrícola de Huazhong utilizaron tecnologías avanzadas de secuenciación para reconstruir ese mapa con mucho más detalle.

El resultado fue un genoma de 289,6 millones de pares de bases, distribuido en 20 cromosomas, con solo ocho espacios pendientes de resolver. Las versiones anteriores tenían más de 10.000.

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¿Qué genes influyen en la forma y la pulpa de la calabaza?

Para investigar qué partes del genoma están relacionadas con las características del fruto, el equipo analizó 200 plantas descendientes de calabazas con formas diferentes.

Así identificaron 165 regiones genéticas asociadas con 20 características, entre ellas el tamaño, la forma, el contenido de azúcares y el grosor de la pulpa.

Dos hallazgos llamaron especialmente la atención:

• Un gen relacionado con la β-tubulina, una proteína que participa en la estructura de las células, apareció como candidato para explicar por qué algunas calabazas crecen más anchas y otras más alargadas.
• Un gen llamado IAA9, relacionado con la respuesta a una hormona vegetal, fue identificado como candidato para influir en el grosor de la pulpa.

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¿Para qué sirve conocer mejor el ADN de la calabaza?

La forma, el tamaño y la cantidad de pulpa son características importantes para el cultivo y la comercialización de calabazas.

Identificar las regiones del ADN relacionadas con estos rasgos puede ayudar a los investigadores a estudiar cómo se heredan y, en el futuro, facilitar el desarrollo de variedades con características específicas.

Además, el nuevo mapa podría servir como referencia para investigaciones que utilicen edición genética, pues ya cuentan con información de mayor precisión acerca de dónde buscar las instrucciones genéticas que influyen en el desarrollo de estos frutos.

En resumen

• Los científicos construyeron un mapa casi completo del genoma de la calabaza, con solo ocho espacios sin resolver.
• Identificaron 165 regiones genéticas asociadas con características del fruto y dos genes candidatos relacionados con su forma y el grosor de la pulpa.
• El hallazgo puede apoyar futuras investigaciones y estrategias de mejoramiento, pero no supone la creación de una calabaza genéticamente modificada.

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