Variedades de pepino: el pangenoma revela claves para cultivos más productivos

Variedades de pepino. Detrás de cada forma, tamaño y textura hay una historia genética compleja. Ahora, científicos lograron construir el mapa genético más completo del pepino hasta la fecha, revelando información que podría transformar el mejoramiento de este cultivo.

El equipo analizó 39 variedades distintas y construyó un pangenoma, es decir, un mapa que reúne toda la diversidad genética de la especie, no solo la de una planta de referencia.

El resultado: identificaron 171.892 variantes estructurales en el ADN del pepino.

¿Quieres conocer qué otro pangenomas se han conocido recientemente? Haz clic aquí > pangenoma de la papa o pangenoma de la berenjena

¿Qué significa eso exactamente?

Las variantes estructurales son cambios grandes en el ADN. No se trata de pequeñas “letras” modificadas, sino de fragmentos que pueden estar:

• Insertados
• Eliminados
• Reorganizados en otra posición

Estos cambios amplios pueden influir directamente en rasgos visibles, como:

• La forma del fruto
• La firmeza
• La tolerancia al estrés
• La aparición del llamado “hueco interno”
   

¿Qué es el hueco interno del pepino?

El hueco interno es una cavidad que se forma en el centro del pepino cuando el tejido interno no se desarrolla de manera uniforme.

En mercados de consumo fresco, este defecto reduce la calidad comercial porque afecta la textura y la apariencia del fruto al cortarlo.

Comprender qué variantes estructurales influyen en este rasgo permite a los mejoradores seleccionar plantas que produzcan frutos más uniformes y consistentes.
 

Una “limpieza” genética a lo largo de la evolución

El estudio, publicado en Nature Genetics y liderado por el profesor Zhangjun Fei del Instituto Boyce Thompson (BTI), reveló un proceso interesante. A lo largo de la historia evolutiva del pepino, los cambios genéticos pequeños se conservaron con frecuencia.

Pero los cambios estructurales grandes que afectaban negativamente la salud de la planta fueron eliminados por selección natural.

Sin embargo, cuando el pepino se expandió desde la India hacia otras regiones del mundo, algunas variantes menos favorables quedaron ligadas a genes beneficiosos.

Esto explica por qué, en el mejoramiento tradicional, al seleccionar una característica deseada a veces aparecen otras no planeadas. No es un error. Es genética heredada en bloque.
 

Impacto directo en nuevas variedades de pepino

El aporte práctico es enorme. Al integrar estas variantes estructurales en modelos de predicción, los científicos pueden anticipar con mayor precisión cómo crecerá una planta antes de evaluarla en campo.

Eso significa:

• Desarrollo más eficiente de nuevas variedades de pepino
• Mejor calidad de fruto
• Mayor resiliencia
• Menos ensayo y error en los programas de mejoramiento

Además, este enfoque basado en pangenomas podría aplicarse a otros cultivos estratégicos.Ya no se trabaja con un solo “modelo genético”. Se trabaja con toda la diversidad disponible. Y eso cambia la velocidad del mejoramiento.

¡Nuevo! Resumen en 3 claves

• Científicos analizaron 39 variedades y construyeron el pangenoma más completo del pepino.
• Identificaron más de 170 mil variantes estructurales, es decir, grandes cambios en fragmentos del ADN que influyen en forma, calidad y resiliencia del fruto.
• Este conocimiento permite desarrollar nuevas variedades de pepino más uniformes, productivas y adaptadas a las necesidades del mercado.